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统计检验+可视化!绘制“一举两得”的显著性箱线图!

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发表于 2022.6.27 14:30:22 | 显示全部楼层 |阅读模式
如何通过图形将分组数据的整体分布、中位数信息、上下限呈现?——箱线图!

那怎么在箱线图基础上,还能直观看出组间的显著性差异信息?
——显著性箱线图!整合了一系列信息,通过组间连线及星标,直观表达出组间显著性差异的信息。


OmicShare Tools的两组检验箱线图工具即可对样本进行差异分析,并将结果可视化,实属方便!

工具链接:https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/box_mul_sig


数据准备

工具兼容两组多组(不超过10组)数据,多组时两两分组进行比较。

整理数据时,每一列为一组,第一行为分组名;每组至少有3个重复。

示例:


参数选择

一、

统计检验方法提供t检验(t-test)及Wilcoxon秩和检验

-t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均数的差异是否显著。

-Wilcoxon秩和检验,也称Mann-Whitney U检验,是一种非参数检验,在不需要假设两个样本空间都为正态分布的情况下,测试它们的分布是否完全相同。

二、


注意,行名通常指的是第一列是否为样本名称。

如下图,左表为没有行名;右表有样本名称,需要选择"是"有行名。


Q:为什么提示数据重复?
A:如果行名参数选择“是”,表格中样本名(既第一列的行名)是不允许重复的。

分析结果

提交后,稍等片刻即可点击下载得到结果~


Q:为什么出错或下载没有图片呢?
A:任务无结果或出错可以先检查下:①分组超过10组;②数据表中并没有行名(即上文说的第一列样本名),但是行名参数却选了“是”。

正常结果包含:
Ttest(或Wilcoxon).Pvalue. xls:T检验(或秩和检验)差异检验结果
T-test(或Wilcoxon).diff.pdf/png:显著性箱线图,含pdf、png格式
T-test(或Wilcoxon).diff.jitter.pdf/png:带散点的显著性箱线图,含pdf、png格式



其中:*代表p值小于0.05,**代表p值小于0.01,***代表p值小于0.001,ns大于0.05,为不显著

OmicShare Tools拥有157个生信工具,引用sci超2200+篇!轻松完成生信分析、可视化绘图!快拿上数据去实操绘制吧!

链接:https://www.omicshare.com/tools/

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钵水母

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