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多组学主题最后一波免费直播课!

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发表于 2019.11.26 10:19:33 | 显示全部楼层 |阅读模式
11月接近尾声,我们的多组学主题月也迎来了最后一周的直播课程~之前的直播课内容各位观众觉得实用吗?是否对你的研究有一点小小的帮助呢?本周我们也给大家带来两节免费直播课,下面一起来看看课程内容吧!

周三:基因组多组学研究

利用遗传图谱进行QTL定位可以锁定与性状相关的QTL,但由于双亲的遗传多样性有限,传统QTL定位得到的定位区间较大,查找基因比较繁琐且无法确定具体的候选基因。


GWAS同样是将个体的基因型和表型进行统计学分析,筛选出最有可能影响该性状的遗传变异的过程。因为样本间遗传变异比较丰富,得到的定位区间会比较小,但是假阳性会比较高。


将图谱定位与GWAS相结合,可以弥补两种方法的不足,可以在保证准确率的情况下缩小定位区间。

近几年的文章中,大家开始使用QTL的定位来验证GWAS的结果,通过将QTL定位与GWAS相结合,可以快速的缩小定位区间,锁定候选基因,为进一步对目标基因的研究打下良好的基础。文章的主要思路如下:


本节课,我们将从图谱定位和GWAS技术入手,对两种技术进行简要的介绍。并且结合相关案例,为大家解析两种技术应该如何关联分析。如果对图谱定位和GWAS技术感兴趣,欢迎前来观看本周三的在线课堂。


课程名称:
《如何联合图谱与GWAS提高QTL定位的精度》

时间:11月27日(周三)16:00
直播QQ群基迪奥Omicsmart基因组群
                【903695710】


周四:转录组多组学研究

翻译组、蛋白组和代谢组又称为后转录调控的组学,可以互相组合进行研究,一般由于转录组学研究最为广泛,所以多数会与转录组进行关联分析。本期在线课堂将以转录组为基础,介绍研究较多的蛋白组学和代谢组学以及新技术——翻译组学,分别与转录组学关联分析的研究思路,主要内容如下:


1、翻译组与转录组关联分析:翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,将翻译组与转录组联合分析,可以比较基因在转录水平与翻译水平的差异、获得不同处理条件下基因的翻译效率变化、精确研究转录后调控和翻译调控机制、有助于深入了解表型变化的调控机理。


图1 翻译组与转录组关联分析结果

2、蛋白质组与转录组关联分析:蛋白质谱技术能对基因经过转录翻译得到的蛋白质进行测定与定量,得到机体组织最后发挥功能的蛋白信息。因此同步检测样本中mRNA与蛋白质的表达,将两个组学数据整合分析,不仅能在蛋白质水平及转录水平两个不同层次上解释生命活动的规律与本质,还能揭示二者之间的相互调控或者关联关系。


图2 蛋白组与转录组关联分析结果图

3、代谢组与转录组关联分析:代谢组是对生物样本中所有低分子量代谢产物进行定性和定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相关关系的一门科学。代谢组学是基因组与表型之间的桥梁,将转录组与代谢组联合分析,能够更好地找到关键调控代谢通路与基因,解释生物体生长发育、环境响应、生理状态、病理应答等分子机制。


图3 基因-代谢调控网络

想要更详细了解这些组学的关联分析与应用,就来参加我们周四的直播课堂吧~

课程名称《转录组与翻译组、蛋白、代谢的关联研究转录后调控
时间11月28日(周四)16:00
直播QQ群基迪奥Omicsmart转录组群
                【867486887】


课程预告

多组学主题月的直播课本周就要结束了,但是——我们的主题月活动还在继续!12月份,基迪奥将举行“组学研究新技术主题月”活动,我们同样将在四个群里为大家准备了免费的直播课~新的分析手段、新的绘图方法、新的研究思路,希望我们直播课的讲解能为你的研究打开新大门!

12月课程表课程表

扫码加群,关注免费直播课



如果不能参加直播课程,可以在直播结束后登录基迪奥在线课堂网站,观看已录播的多组学系列课程,充值VIP会员可以免费观看已上线的全部在线课程。

视频观看方式:

电脑端:  
登录Omicshare课堂

手机端:
通过点击基迪奥微信公众号底部菜单栏【视频教程】观看学习


参考文献:
Huang X , Zhao Y , Wei X , et al.Genome-wide association study of flowering time and grain yield traits in aworldwide collection of rice germplasm[J]. Nature Genetics, 2012, 44(1):32.

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中华鲟

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发表于 2019.11.27 08:26:16 | 显示全部楼层
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中华鲟

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 楼主| 发表于 2019.11.28 09:24:12 | 显示全部楼层

帖子里有可以回看录像的地址,今天就会将昨天的课更新上去啦!
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钵水母

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发表于 2022.1.28 10:26:05 | 显示全部楼层
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